MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021490	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	512556091
2	NC_021490	A	6	6	250	255	100 %	0 %	0 %	0 %	512556091
3	NC_021490	C	6	6	280	285	0 %	0 %	0 %	100 %	512556091
4	NC_021490	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	512556091
5	NC_021490	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
6	NC_021490	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556091
7	NC_021490	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556091
8	NC_021490	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	512556091
9	NC_021490	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556091
10	NC_021490	A	9	9	628	636	100 %	0 %	0 %	0 %	512556091
11	NC_021490	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556091
12	NC_021490	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	512556091
13	NC_021490	T	7	7	678	684	0 %	100 %	0 %	0 %	512556091
14	NC_021490	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556091
15	NC_021490	A	9	9	742	750	100 %	0 %	0 %	0 %	512556091
16	NC_021490	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
17	NC_021490	A	7	7	886	892	100 %	0 %	0 %	0 %	512556091
18	NC_021490	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556091
19	NC_021490	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556091
20	NC_021490	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	512556091
21	NC_021490	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
22	NC_021490	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556091
23	NC_021490	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
24	NC_021490	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556091
25	NC_021490	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556091
26	NC_021490	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
27	NC_021490	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556091
28	NC_021490	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556091
29	NC_021490	A	6	6	1310	1315	100 %	0 %	0 %	0 %	512556091
30	NC_021490	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	512556091
31	NC_021490	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021490	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021490	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021490	TTC	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021490	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021490	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021490	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021490	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021490	GGA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021490	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021490	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556092
42	NC_021490	AGCAC	2	10	1683	1692	40 %	0 %	20 %	40 %	512556092
43	NC_021490	A	8	8	1710	1717	100 %	0 %	0 %	0 %	512556092
44	NC_021490	T	6	6	1726	1731	0 %	100 %	0 %	0 %	512556092
45	NC_021490	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556092
46	NC_021490	T	6	6	1846	1851	0 %	100 %	0 %	0 %	512556092
47	NC_021490	TGT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556092
48	NC_021490	CAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556092
49	NC_021490	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556092
50	NC_021490	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	512556092
51	NC_021490	AGG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556092
52	NC_021490	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	512556092
53	NC_021490	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556092
54	NC_021490	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556092
55	NC_021490	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	512556092
56	NC_021490	A	7	7	2182	2188	100 %	0 %	0 %	0 %	512556092
57	NC_021490	GCA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556092
58	NC_021490	T	8	8	2313	2320	0 %	100 %	0 %	0 %	512556092
59	NC_021490	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556092
60	NC_021490	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556092
61	NC_021490	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556092
62	NC_021490	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556092
63	NC_021490	CAG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556092
64	NC_021490	TTG	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556092
65	NC_021490	GAA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556092
66	NC_021490	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	512556092
67	NC_021490	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556092
68	NC_021490	AGG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556092
69	NC_021490	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556092
70	NC_021490	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	512556093
71	NC_021490	T	8	8	2837	2844	0 %	100 %	0 %	0 %	512556093
72	NC_021490	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556093
73	NC_021490	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	512556093
74	NC_021490	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	512556093
75	NC_021490	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	512556093
76	NC_021490	A	7	7	3058	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	512556093
77	NC_021490	A	7	7	3072	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	512556093
78	NC_021490	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556093
79	NC_021490	T	6	6	3109	3114	0 %	100 %	0 %	0 %	512556093
80	NC_021490	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556093
81	NC_021490	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	512556093
82	NC_021490	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	512556093
83	NC_021490	TAT	2	6	3373	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556093
84	NC_021490	CTC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556093
85	NC_021490	GAG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556093
86	NC_021490	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	512556093
87	NC_021490	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556093
88	NC_021490	ATG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556093
89	NC_021490	A	6	6	3788	3793	100 %	0 %	0 %	0 %	512556093
90	NC_021490	AAT	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556093
91	NC_021490	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	512556094
92	NC_021490	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	512556094
93	NC_021490	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	512556094
94	NC_021490	CGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556094
95	NC_021490	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	512556094
96	NC_021490	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556094
97	NC_021490	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556094
98	NC_021490	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021490	GCCC	2	8	4382	4389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_021490	GAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556095
101	NC_021490	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556095
102	NC_021490	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	512556095
103	NC_021490	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	512556095
104	NC_021490	CGAAG	2	10	4771	4780	40 %	0 %	40 %	20 %	512556095
105	NC_021490	A	6	6	4816	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	512556095
106	NC_021490	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556095
107	NC_021490	TCT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556095
108	NC_021490	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556095
109	NC_021490	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556095
110	NC_021490	TAC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556095
111	NC_021490	ACG	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556095
112	NC_021490	GTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556095
113	NC_021490	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	512556095
114	NC_021490	ATC	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556095
115	NC_021490	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556095
116	NC_021490	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556095
117	NC_021490	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556095
118	NC_021490	GGA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556095
119	NC_021490	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	512556095
120	NC_021490	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556095
121	NC_021490	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	512556095
122	NC_021490	GAT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556095
123	NC_021490	AGA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556095
124	NC_021490	GGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556095
125	NC_021490	GGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556095
126	NC_021490	TTA	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556095
127	NC_021490	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	512556095
128	NC_021490	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	512556095
129	NC_021490	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	512556095
130	NC_021490	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556095
131	NC_021490	ACT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556095
132	NC_021490	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	512556095
133	NC_021490	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556095
134	NC_021490	TTA	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556095
135	NC_021490	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	512556095
136	NC_021490	AAC	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556095
137	NC_021490	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556095
138	NC_021490	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	512556095
139	NC_021490	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512556095
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141	NC_021490	GTG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556095
142	NC_021490	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	512556095
143	NC_021490	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	512556095
144	NC_021490	TAG	3	9	6798	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556095
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147	NC_021490	GGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021490	T	6	6	7076	7081	0 %	100 %	0 %	0 %	512556096
149	NC_021490	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	512556096
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158	NC_021490	ACT	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556097
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173	NC_021490	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021490	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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176	NC_021490	GCA	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_021490	ATC	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_021490	CCGT	2	8	9126	9133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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257	NC_021490	G	10	10	12477	12486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021490	GA	3	6	12511	12516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021490	GT	3	6	12519	12524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021490	GGT	2	6	12575	12580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556099
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263	NC_021490	GGA	2	6	12653	12658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556099
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272	NC_021490	GT	3	6	13143	13148	0 %	50 %	50 %	0 %	512556099
273	NC_021490	GAG	2	6	13176	13181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556099
274	NC_021490	GCGT	2	8	13220	13227	0 %	25 %	50 %	25 %	512556099
275	NC_021490	CA	4	8	13235	13242	50 %	0 %	0 %	50 %	512556099
276	NC_021490	GAA	2	6	13268	13273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556099
277	NC_021490	TGA	2	6	13315	13320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556099
278	NC_021490	GA	3	6	13319	13324	50 %	0 %	50 %	0 %	512556099
279	NC_021490	CGG	2	6	13441	13446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556099
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281	NC_021490	GC	3	6	13530	13535	0 %	0 %	50 %	50 %	512556099
282	NC_021490	CT	4	8	13579	13586	0 %	50 %	0 %	50 %	512556099
283	NC_021490	GTTT	2	8	13597	13604	0 %	75 %	25 %	0 %	512556099
284	NC_021490	TCT	2	6	13643	13648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556099
285	NC_021490	GAAG	2	8	13655	13662	50 %	0 %	50 %	0 %	512556099
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287	NC_021490	GTC	2	6	13768	13773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556099
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289	NC_021490	GTG	2	6	13907	13912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021490	T	7	7	13932	13938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021490	GTT	2	6	13995	14000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556100
292	NC_021490	T	6	6	13999	14004	0 %	100 %	0 %	0 %	512556100
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299	NC_021490	G	7	7	14290	14296	0 %	0 %	100 %	0 %	512556100
300	NC_021490	CG	3	6	14300	14305	0 %	0 %	50 %	50 %	512556100
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369	NC_021490	GTTTT	2	10	18344	18353	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
370	NC_021490	CGAT	2	8	18416	18423	25 %	25 %	25 %	25 %	512556102
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392	NC_021490	GAA	2	6	19553	19558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556103
393	NC_021490	ATT	2	6	19587	19592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556103
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399	NC_021490	GTTA	2	8	19790	19797	25 %	50 %	25 %	0 %	512556103
400	NC_021490	A	6	6	19887	19892	100 %	0 %	0 %	0 %	512556103
401	NC_021490	CG	3	6	19910	19915	0 %	0 %	50 %	50 %	512556103
402	NC_021490	AGG	2	6	19936	19941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556103
403	NC_021490	TTG	2	6	19954	19959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556103
404	NC_021490	T	7	7	19983	19989	0 %	100 %	0 %	0 %	512556103
405	NC_021490	AGA	2	6	19999	20004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556103
406	NC_021490	ATG	2	6	20125	20130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556103
407	NC_021490	GAG	2	6	20202	20207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556103
408	NC_021490	GTTTT	2	10	20299	20308	0 %	80 %	20 %	0 %	512556103
409	NC_021490	G	6	6	20320	20325	0 %	0 %	100 %	0 %	512556103
410	NC_021490	GT	3	6	20343	20348	0 %	50 %	50 %	0 %	512556103
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